SharePoint/OneDrive for Businessに、アップロードできない拡張子の制限はありません。
SharePointのドキュメントライブラリへアップロードできるファイルサイズには制限があります。
また、ドラッグ&ドロップでのフォルダ単位の同期は、Windows 10 のEdge か Chrome でのみ可能です。IE と Firefoxではできないのでご注意ください。
【参考】SharePoint: ソフトウェアの境界と制限
https://support.office.com/ja-jp/article/HA102694293
【参考】ファイルをライブラリにアップロードする
https://support.office.com/ja-jp/article/HA102803549